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台中在來 1 號⽔稻基因體的組裝和註釋有助於了解其性狀

為了解決 venu的問題，作者杰羅姆 這樣論述：

台中在來 1 號（TN1）是IR8 “奇蹟稻” 的姊妹品種，它開啟了水稻綠色革命（GR）。 TN1 和 IR8 均為低腳烏尖 (Dee-geo-woo-gen, DGWG) 栽培種的直系子代。因此，我們對 TN1 的基因體進行了測序和組裝。它由 PacBio 和 Illumina 二個平台組合測序。基因體主要由 Canu 使用 PacBio 長讀序資料重新組裝。以 R498為參考的基因體，參考RaGOO引導組裝方法輸出染色體水平的組裝，N50 為 33.1 Mb，基因體大小為 409.5 Mb。然後，使用 Illumina 讀值來改善組裝的基因體，包括校正測序錯誤。 TN1 基因體中共預測了

37,526 個基因，其中 24,102 個基因被 Blast2GO鑑定了功能。這種高品質的組裝和註釋與 IR8、MH63 和 IR64 的組裝和註釋，一起用於建立具有 16,999 個核心直向同源組的綠色革命水稻的泛基因體。通過 GR 泛基因體，我們能夠解開 TN1 和 IR8澱粉合成基因的差異，這可能與它們的穀粒產量差異有關。我們還研究了它們的開花基因，以闡明它們對光週期不敏感的基因體基礎。對 TN1 和 IR8 的 sd1（半矮性）基因的分析更正了382 bp 片段的缺失，並通過 Sanger 測序進行驗證。 sd1 基因的外顯子-內含子結構在 TN1和 IR8 之間也不同；前者俱有與

日本晴相關的缺失模式，其中外顯子 1 的後半部分至第二外顯子的一部分丟失。但是，在 IR8 sd1 的註釋中並非如此。我們還研究了為什麼 TN1 易受稻熱病影響。以抗稻熱病 Tetep 品種的基因為參考，我們發現 R 基因 Pi-ta 發生突變，使 Pi54 缺失。來自 3,000 水稻基因體測序的栽培品種的單倍型分析，也支持我們的結論。由這兩個基因的解序，我們懷疑 Pi54 的缺失是 TN1 對稻熱病高感性的部分原因。 TN1 的基因體分析提供了對綠色革命早期歷史的瞭解，並可能為提高糧食產量和抗病能力提供線索。

台灣一般族群塑化劑暴露與肝功能指標之相關性探討

為了解決 venu的問題，作者薛雅文 這樣論述：

背景：鄰苯二甲酸酯類塑化劑（phthalate esters, PAEs）又稱增塑劑、可塑劑，因其化合物特性可使材料更柔軟，易於加工，所以被廣泛製造及使用；然而，近年來台灣產生的塑化劑醜聞事件，讓大眾開始重視塑化劑的使用，成為公眾關注的議題。在近十年裡，肝功能損傷疾病已成為全球死亡和疾病的主要原因之一，然而，在目前尚未有亞洲國家進行PAEs暴露與肝功能健康危害等文獻之探討。目的：探討PAEs的暴露(每日攝入量、累積風險評估)與肝功能指標的關聯性。材料與方法：以台灣人體生物資料庫– BioBank收集到的案件為研究對象，納入763員，採橫斷式研究設計（Cross-sectional study

）進行資料庫分析。本研究使用尿液之PAEs代謝物，包含mono（2-ethylhexyl）phthalate（MEHP）、mono-n-butyl phthalate（MBP）、monobenzyl phthalate（MBzP）、mono（2-ethyl-5-oxohexyl）phthalate（MEOHP）及mono（ 2-ethyl-5- hydroxyhexyl）phthalate（MEHHP）、monomethyl phthalate（MMP）、monoethyl phthalate（MEP）等，計算參考每日攝入量（DI）、危害商數（Hazard quotient, HQ）及危害指標

（Hazard index, HI），肝功能指標包括總膽紅素( total bilirubin, TBIL)、白蛋白(Albumin, ALB)、天門冬安酸轉氨酶（SGOT，又稱AST）、丙氨酸轉氨酶（SGPT，又稱ALT）、丙麩胺醯氨轉酸酶（γ-Glutamyl transpeptidase, GGT或γ-GT），並利用多元線性回歸模型，探討台灣民眾在PAEs暴露濃度與肝功能指標間的關聯性。結果：本研究中健康成人之暴露潛在來源以DEHP及 DnBP為主，HIRfD有99%數值小於1，表示研究對象之PAEs累積風險（HI），皆低於可能引起人體危害的劑量。使用線性迴歸模型分析並控制婚姻程度、教育

程度、喝咖啡習慣、攝取維生素習慣、運動習慣等變項後發現，DnBP高攝入量組其SGPT顯著較低攝入量組高（beta=0.101，95%信賴區間：0.013, 0.190）；其γ-GT顯著較低攝入量組高（beta=0.144，95%信賴區間：0.039, 0.250）。DEHP高攝入量組其SGPT顯著較低攝入量組高（beta=0.103，95%信賴區間：0.014, 0.192）；γ-GT顯著較低攝入量組高（beta=0.141，95%信賴區間：0.035, 0.246）。HIRfD高危害組其SGPT顯著較低危害組高（beta=0.102，95%信賴區間：0.014, 0.191）；γ-GT顯著較

低攝入量組高（beta=0.127，95%信賴區間：0.021, 0.233）。結論：研究結果顯示塑化劑暴露可能會影響肝功能的健康效應，未來需再用更多長期性追蹤研究加以證實。